| 序号 | 奖种 | 类别 | 等级 | 获奖项目名称 | 主要完成人 | 获奖年份 | 备注 |
| 1 | 教育部科学研究优秀成果奖 | 工程技术研究成果奖 | 二等 | 果粮、果菜套种关键技术创新与应用 | 王世平 | 2025 | |
| 2 | 中国轻工业联合会科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 青砖茶加工关键技术创新与应用 | 魏新林 | 2024 | 等同省部级 |
| 3 | 中国轻工业联合会科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 植物功能色素与多糖高效利用关键技术创新与应用 | 敬璞 | 2023 | 等同省部级 |
| 4 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 水稻白叶枯病和条斑病绿色防控关键技术与应用 | 陈功友 | 2022 | |
| 5 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 自然科学奖 | 二等 | 青蒿基因组解析和青蒿素合成及转录调控的分子机制研究 | 唐克轩 | 2022 | |
| 6 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 自然科学奖 | 二等 | 木质纤维素类生物质热裂解制取生物油的基础研究 | 刘荣厚 | 2022 | |
| 7 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 茶制品高值化加工关键技术与应用 | 魏新林 | 2020 | |
| 8 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 农林废物碳化及其资源化高效利用关键技术与应用 | 沈国清 | 2020 | |
| 9 | 中国轻工业联合会科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 高品质茶制品绿色加工关键技术研发与应用 | 魏新林 | 2020 | 等同省部级 |
| 10 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 设施茄果类蔬菜抗逆、优质高效育种技术的研究与品种培育 | 陈火英 | 2019 | |
| 11 | 神农奖中华农业科技奖 | 科学研究类 | 二等 | 木霉菌生防资源评价与植物病害防控菌剂创制技术及应用 | 陈捷 | 2019 | 等同省部级 |
| 12 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 黄瓜分子育种技术创新与新品种选育 | 蔡润 | 2019 | |
| 13 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 二等 | 都市瘦肉型猪遗传改良技术及其集成应用 | 潘玉春 | 2018 | |
| 14 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 种养耦合及其废物循环技术 | 周培 | 2018 | |
| 15 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 优良瘦肉型猪种质创制技术及其应用 | 潘玉春 | 2018 | |
| 16 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 三等 | 番茄分子标记辅助育种技术体系的建立与优质、抗病新品种的培育 | 刘杨 | 2018 | |
| 17 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 集约化养猪的氧化应激与营养调控技术研究与应用 | 徐建雄 | 2017 | |
| 18 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 新耕作制度下玉米主要病虫害发生规律与绿色防控关键技术 | 陈捷 | 2016 | |
| 19 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 木霉菌资源筛选与植物病害生物防治技术创新与应用 | 陈捷 | 2016 | |
| 20 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 黄瓜主要农艺性状基因定位克隆及应用 | 蔡润 | 2015 | |
| 21 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 蔬菜质量安全信息化技术体系的集成与应用 | 黄丹枫 | 2015 | |
| 22 | 上海市科学技术奖 | 技术发明奖 | 二等 | 青蒿代谢工程育种及综合利用技术集成 | 唐克轩 | 2014 | |
| 23 | 国家科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 南方葡萄根域限制与避雨栽培关键技术研究与示范 | 王世平 | 2013 | |
| 24 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 问题土壤修复及农田健康维护技术研究与应用 | 奥岩松 | 2013 | |
| 25 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 木霉菌资源筛选与生物菌剂创制及其应用 | 陈捷 | 2012 | |
| 26 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 三等 | 大肠杆菌O157和猪链球菌2型的快速监测和综合防控 | 严亚贤 | 2012 | |
| 27 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 南方葡萄避雨栽培关键技术研究与示范 | 王世平 | 2011 | |
| 28 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 三等 | 戊肝病原学、流行病学、致病机制和综合防治技术研究 | 华修国 | 2011 | |
| 29 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 二等 | 玉米主要病害发生与寄主抗性机理和生态化控制技术研究 | 陈捷 | 2010 | |
| 30 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 一等 | 葡萄根域限制栽培技术研究与示范 | 王世平 | 2009 | |
| 31 | 高等学校科学研究优秀成果奖 | 科技进步奖 | 二等 | 附红细胞体病的病原学、流行病学及综合防控技术的研究 | 华修国 | 2009 | |
| 32 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 一等 | 工厂化育苗关键技术创新集成及产业化示范与推广 | 黄丹枫 | 2008 | |
| 33 | 上海市科学技术奖 | 科技进步奖 | 二等 | 黄瓜分子标记与新品种选育 | 蔡润 | 2008 |