上海交通大学农业与生物学院的前身是上海农学院。1999年9月，有着40年历史的上海农学院并入上海交通大学，成立了上海交通大学农学院，2002年3月将农学院更名为农业与生物学院。
    现有5个系(植物科学系、动物科学系、园林科学与工程系、资源与环境系、食品科学与工程系)、3个中心（实验教学中心、植物生物技术研究中心、教学实验实习场），以及新农村发展研究院、崇明生态农业研究中心、陆伯勋食品安全研究中心、复旦-交大-诺丁汉植物生物技术研发中心、生物技术研究所、草业科学研究所、芳香植物研究中心、区域发展研究所等教学科研部门。拥有上海市重点学科4个（作物遗传育种、兽医传染病与预防兽医学、农艺学、园林学），上海市重点实验室1个（上海市兽医生物技术重点实验室）。
    学院有5个专业（植物生物技术、动物生物技术、资源与环境、园林、食品科学与工程）培养本科生；有14个二级学科硕士学位点（蔬菜学、果树学、植物病理学、农药学、动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖、草业科学、食品科学、农产品加工及储藏工程、预防兽医学、园林植物与观赏园艺、作物遗传育种学、生态学、植物学）培养全日制硕士研究生；有 3个专业硕士学位点（农业推广、兽医推广、风景园林）培养专业硕士研究生；有 7个一级或二级博士学位点（环境科学与工程、预防兽医学与畜禽产品安全、生物技术、食品冷藏工程、植物学、生态学、蔬菜学）培养博士研究生。现有本科生630名、研究生近300名。
    学院以学科梯队建设为抓手，进一步凝炼学科，建有3个研究团队、14个研究方向，科学研究能力和水平明显提高。目前，在研的国家“863”、“973”、自然科学基金、科技部攻关、星火计划及市重点等重大重要项目50余项；科研到位经费大幅增长，2003、2004两年达3100余万元，2005年达2000万元，2006年达到2700万元。近三年来，共获得市科技进步二等奖三项、三等奖六项；发表论文(核心期刊)每年超过130篇。2004年，发表核心期刊论文161篇,SCI收录论文32篇，EI收录论文9篇，申请专利54项，获专利授权(软件著作权)9项；2005年，发表核心期刊论文204篇,SCI收录论文49篇，EI收录论文7篇，申请专利80项，获专利授权(软件著作权)20项。2006年SCI论文71篇（2005年50篇）；EI 32篇，专利授权40项（其中新品种8项）。
    学院将瞄准国际未来农业与新生命科学发展趋势，以国际一流综合型大学现代农科发展框架为目标，参照国家和上海“十一五”科技发展总体规划和现代农业生物技术未来发展对人才需求，通过体制创新与学科多维交叉，创出一流综合性大学建设现代农科的新途径，完成由教学研究型向研究型办学转变；以生物技术、生态农业和食品安全为主攻方向明确重点，建成2-3个在国内同类院校排名前列的学科或方向；成为中国现代农业发展的一流农科和精英人才培养的国内高水平农科院校和培养基地。